跨膜结构域(跨膜结构域预测网站)

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膜结构域是什么?是不是就是跨膜结构域啊?

1、就是跨膜结构域,包括α螺旋β折叠。主要是α螺旋。

2、是跨膜蛋白的效应区域所展现。预测:依靠一个跨膜蛋白数据库,包含了每个序列的一些附加信息:如跨膜结构区域的数量、跨膜结构域的位置及其侧翼序列的情况。蛋白质序列中跨越细胞膜的区域,通常为α-螺旋结构,约20~25个氨基酸残基。构成他的蛋白质的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。

3、跨膜结构域(transmembrane domain,TM),常常是由跨膜蛋白的效应区域所展现。 跨膜蛋白,通俗说即跨越膜的两端的蛋白质,其跨膜部分为β桶或α螺旋结构。

4、膜结构也叫张拉膜结构,它是上世纪中期才发展起来的一种新型建筑结构,不仅打破了传统建筑风格的模式,还凭借自身特有的优势,被应用在很多领域设施。它是由多种高、强、薄材料及钢架、钢柱和钢索通过某种适当的方式,让其内部能形成预张力可以覆盖及承载外在负荷的一种空间结构形式。

5、膜结构是什么?汇集膜结构建筑的特点及应用领域: 膜结构是一种全新的建筑结构形式,它集建筑学、结构力学、精细化工与材料科学、计算机技术等为一体,具有很高技术含量。

6、跨膜结构域预测一半是为了分析蛋白质的定位。如果有,就可能是膜蛋白,这对分析其功能、制定纯化方案以及表达方式都很有帮助。如果确定是膜蛋白,功能就可能是受体、通道之类的,纯化就按疏水蛋白来设计,表达就要考虑真核表达系统。

膜内在蛋白以哪些主要方式与膜脂结合?

膜内在蛋白与膜脂结合的主要方式有:(1)疏水性相互作用:膜内在蛋白跨膜结构域通过范德华力等与脂双层分子进行疏水性相互作用,跨膜结构域是与膜脂结合的主要部位。这些结构域主要有α螺旋、β折叠片结构。

内在膜蛋白与膜脂结合的方式 〔1〕膜蛋白的跨膜结构域与脂双层分子的疏水核心的相互作用。〔2〕跨膜结构域两端携带正电荷的氨基酸残基与磷脂分子带负电的极性头形成离子键,或带负电的氨基酸残基通过Ca2+、Mg2+等阳离子与带负电的磷脂极性头相互作用。

① 膜蛋白的跨膜结构域与脂双层分子的疏水核心的相互作用,这是内在膜蛋白与膜脂结合的最主要和最基本的结合方式。② 跨膜结构域两端携带正电荷的氨基酸残基,如精氨酸、赖氨酸等与磷脂分子带负电的极性头部形成离子键;或带负电的氨基酸残基通过Ca2+、Mg2+等阳离子与带负电的磷脂极性头部相互作用。

试述生物膜膜内在蛋白三维结构的解析的重要性与困难。

重要性:由于膜内在蛋白占整个膜蛋的70%~80%,且它们的功能几乎含概了细胞生存的各个方面。如物质运输,信号转导,代谢催化,所以其结构的解析对于深入了解其作用机制,进而了解生命奥秘有十分重要的意义。

生物膜上存在着两种主要类型的膜蛋白:内在膜蛋白和外周膜蛋白。内在膜蛋白,也称为全嵌入蛋白,它们的疏水核部分深入到脂双层中,形成一个稳定的结构。这些蛋白质完全跨过生物膜,确保了它们在膜两侧的功能执行。相比之下,外周膜蛋白与内在膜蛋白有所不同。

生物膜功能涉及物质运输、能量转换、信号转导等重要生命活动,其中无不涉及蛋白质的作用,蛋白质一方面保证了膜适当的流动性,还可以作为物质运输的载体或通道、胞外信号的受体、膜酶等等。由此,看来解析膜蛋白的三维结构和功能意义确实非同寻常。

外在膜蛋白为水溶性蛋白质,通过改变溶液的离子强度甚至提高温度就可以从膜上分离下来,但膜结构并不改变。如磷脂酶 脂锚定膜蛋白是通过与之相连的脂肪酸或磷脂插入膜的脂双分子中,从而锚定在细胞质膜上,其水溶性的蛋白质部分位于脂双层外。脂锚定膜蛋白有三种类型。

内在蛋白通过疏水键与膜脂比较牢固结合,分离较困难,只有用较剧烈的条件如:去垢剂、有机溶剂、超声波等才能抽提出来,因为它们具有水不溶性,除去萃取剂后又可重新聚合成不溶性物质。占70-80%。(三)糖生物膜中的糖以寡糖的形式存在,通过共价键与蛋白形成糖蛋白,少量还可与脂类形成糖脂。

为什么要对蛋白进行跨膜结构域预测?跨膜结构域越多是不是越难分离_百度...

1、跨膜结构域预测一半是为了分析蛋白质的定位。如果有,就可能是膜蛋白,这对分析其功能、制定纯化方案以及表达方式都很有帮助。如果确定是膜蛋白,功能就可能是受体、通道之类的,纯化就按疏水蛋白来设计,表达就要考虑真核表达系统。

2、意义把膜蛋白固定在细胞膜上,所有的跨膜区都具有这项功能。不过有的跨膜区还有自己其它的独特功能,所以不同蛋白的跨膜区功能有相同部分,也有不同部分。蛋白质含有跨膜区,提示它可能作为膜受体起作用,也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。

3、是跨膜蛋白的效应区域所展现。预测:依靠一个跨膜蛋白数据库,包含了每个序列的一些附加信息:如跨膜结构区域的数量、跨膜结构域的位置及其侧翼序列的情况。蛋白质序列中跨越细胞膜的区域,通常为α-螺旋结构,约20~25个氨基酸残基。构成他的蛋白质的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。

生物学上的跨膜结构域指的是什么?怎样预测?

跨膜结构域(transmembrane domain,TM),常常是由跨膜蛋白的效应区域所展现。 跨膜蛋白,通俗说即跨越膜的两端的蛋白质,其跨膜部分为β桶或α螺旋结构。

是跨膜蛋白的效应区域所展现。预测:依靠一个跨膜蛋白数据库,包含了每个序列的一些附加信息:如跨膜结构区域的数量、跨膜结构域的位置及其侧翼序列的情况。蛋白质序列中跨越细胞膜的区域,通常为α-螺旋结构,约20~25个氨基酸残基。构成他的蛋白质的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。

跨膜结构域预测一半是为了分析蛋白质的定位。如果有,就可能是膜蛋白,这对分析其功能、制定纯化方案以及表达方式都很有帮助。如果确定是膜蛋白,功能就可能是受体、通道之类的,纯化就按疏水蛋白来设计,表达就要考虑真核表达系统。

跨膜预测主要预测的是氨基酸,氨基酸内有蛋白质,蛋白质外壁有膜蛋白。

就是跨膜结构域,包括α螺旋β折叠。主要是α螺旋。

跨膜结构域预测结果图怎么看

1、用TMHMM软件看。蛋白结构决定蛋白功能,利用生物学在线软件工具TMHMM Server,v.0版本是蛋白质跨膜螺旋的在线分析工具。TMHMM是由丹麦理工大学生物序列分析中心CBS负责维护。TMHMM使用了最先进的复杂的隐马尔可夫模型Hidden Markov Models数学模型来预测跨膜区域。

2、SMART结果,运行后的结果用图表表示。其实运行后的结果都有明确的解释。因为都是详细的说明。点击图标链接,就能看到该区域的序列,或是一些详细的描述。如上图的跨膜区,点击进去就是该跨膜区从开始到结束的序列。

3、将氨基酸序列输入,得到一个图表,其中数值越大的部分表示这段氨基酸序列的疏水性越强,越有可能是跨膜区域,再与已知的同源蛋白质比较(NCBI中的BLAST),即可大致预测跨膜结构。

4、跨膜结构域预测一半是为了分析蛋白质的定位。如果有,就可能是膜蛋白,这对分析其功能、制定纯化方案以及表达方式都很有帮助。如果确定是膜蛋白,功能就可能是受体、通道之类的,纯化就按疏水蛋白来设计,表达就要考虑真核表达系统。

5、是跨膜蛋白的效应区域所展现。预测:依靠一个跨膜蛋白数据库,包含了每个序列的一些附加信息:如跨膜结构区域的数量、跨膜结构域的位置及其侧翼序列的情况。蛋白质序列中跨越细胞膜的区域,通常为α-螺旋结构,约20~25个氨基酸残基。构成他的蛋白质的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。

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